名侦探柯南工藤新一的复活与黑暗组织的对决

高中生侦探工藤新一为调查黑暗组织被迫服下APTX-4869缩小为柯南，蛰伏于米花町暗中收集情报。此次特别篇中，柯南与灰原哀误食含特殊成分的蛋糕，身体意外暂时恢复原状。工藤新一直面黑暗组织核心成员，展开一场关乎生死存亡的高智商对决，揭开组织神秘面纱。